Een aquaponics systeem is de combinatie van aquacultuur (het kweken van vis) en hydrocultuur (het bodemloos kweken van planten) dat vis en planten samen kweekt in één geïntegreerd systeem. Het viswater en de uitwerpselen leveren een organische voedselbron voor de planten, en de planten filteren op natuurlijke wijze het water voor de vissen.
De derde deelnemers zijn microben (nitrificerende bacteriën). Deze bacteriën zetten ammoniak uit de visafval eerst om in nitrieten en vervolgens in nitraten. Nitraten zijn de vorm van stikstof die planten kunnen opnemen en gebruiken om te groeien. Vaste visafval wordt omgezet in wormenmest dat ook als voedsel voor de planten dient. Door zowel hydrocultuur- als aquacultuursystemen te combineren, profiteert aquaponics van hun voordelen en elimineert het de nadelen van elk.